La compétence Transport a été attribuée aux Départements par l’État en 1982 et, depuis, n’a cessé de s’adapter. Fruit d’un audit et de l’écoute des remarques et des propositions des usagers, le nouveau plan départemental de transport interurbains de voyageurs sépare désormais les usagers voyageurs des scolaires – chacun aura son Mobidoubs aisément identifiable.

L’offre départementale présente trois types de services : des lignes régulières (A, A express, B et C) pour rallier Besançon, Montbéliard, Pontarlier ou Quingey ; des lignes régulières ou sur réservation (B notamment) pour relier communes, bourgs centres et grandes villes ; et des transports à la demande organisés au niveau des Communautés de communes, pour des flux plus modestes. Le tout est organisé pour assurer des liaisons avec les réseaux ferroviaires régionaux (TER), nationaux (Corail, TGV, etc.) et transfrontaliers (Régio, TransN).